25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5561 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  61.25 
 
 		 1350 aa  1670    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  100 
 
 		 1346 aa  2715    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 1352 aa  883    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1251 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 1242 aa  453  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1253 aa  436  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 1269 aa  413  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1271 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1260 aa  377  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.48 
 
 		 1370 aa  351  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  34.26 
 
 		 720 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  26.31 
 
 		 1365 aa  317  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1180 aa  290  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  26.42 
 
 		 862 aa  278  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1133 aa  253  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  27.54 
 
 		 753 aa  233  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3817  hypothetical protein  29.78 
 
 		 474 aa  183  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  27.34 
 
 		 532 aa  128  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 86 aa  49.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  41.25 
 
 		 81 aa  47.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  46.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  36.99 
 
 		 85 aa  46.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 105 aa  46.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  31.71 
 
 		 82 aa  45.8  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>