44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8419 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 490 aa  1015    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0913  hypothetical protein  25.95 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2941  hypothetical protein  28.61 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 1350 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0245  hypothetical protein  29.14 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2352e-41 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0124  hypothetical protein  25.11 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0556  hypothetical protein  24.21 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 75 aa  67.8  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 1352 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  44.3 
 
 		 86 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 69 aa  64.3  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0652  hypothetical protein  27.36 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  46.75 
 
 		 90 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  46.97 
 
 		 1346 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 105 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 106 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  44.93 
 
 		 86 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  44.12 
 
 		 85 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  48.39 
 
 		 82 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  40.32 
 
 		 100 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  45 
 
 		 88 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 82 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  44.62 
 
 		 93 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  50.82 
 
 		 84 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 77 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  40 
 
 		 89 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 359 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  49.25 
 
 		 188 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  40.85 
 
 		 99 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  35.29 
 
 		 107 aa  47  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 108 aa  47  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  42.19 
 
 		 100 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  40.91 
 
 		 85 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  40.62 
 
 		 94 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 78 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  36.49 
 
 		 90 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 78 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 78 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  40.3 
 
 		 85 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2596  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 84 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  37.68 
 
 		 88 aa  44.3  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  44.26 
 
 		 361 aa  43.9  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>