34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0329 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  200  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  76.6 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  47.92 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  47.87 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  47.78 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  34.38 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  34.38 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  45.21 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  44.12 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 1350 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 89 aa  47.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 490 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  39.74 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  35.56 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  36.49 
 
 		 88 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  36.36 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  39.73 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 88 aa  40  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 88 aa  40  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  38.46 
 
 		 82 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  37.33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>