36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0940 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  97.83 
 
 
108 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  90.22 
 
 
108 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  67.39 
 
 
107 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  47.87 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  43.62 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  42.86 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  47.06 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 
77 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  41.46 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  36.99 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
75 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  36.99 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 
85 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  43.55 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 
217 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  35.48 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  36.99 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 
1350 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 
267 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  37.14 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  35.53 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  34.07 
 
 
96 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  31.4 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>