47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0916 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 108 aa  213  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  90.74 
 
 		 108 aa  197  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  90.22 
 
 		 92 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  62.96 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  46.81 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  44.16 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  39.73 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  41.67 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  41.89 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  43.21 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  36.05 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 1350 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  39.24 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  39.73 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  36.76 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 490 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  40.26 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  33.67 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  36.26 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  37.84 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  33.67 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 267 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  34.12 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  34.21 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4302  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2596  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 406 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>