79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7049 on replicon NC_010374
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  76.32 
 
 
86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  53.75 
 
 
106 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  56.34 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  50.63 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
78 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
78 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  46.75 
 
 
490 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  45.68 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
1350 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 
217 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  48.65 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  47.14 
 
 
97 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  47.14 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  47.06 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  49.33 
 
 
359 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  45.59 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  47.06 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  41.89 
 
 
78 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  40.85 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
87 aa  53.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  44.59 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  49.23 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  39.13 
 
 
84 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  39.71 
 
 
99 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  45.71 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  47.89 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  34.67 
 
 
276 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 
267 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  39.53 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  39.71 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  43.84 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  44.12 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  42.25 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 
1352 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  38.46 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  44.64 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  40.35 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
252 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  43.08 
 
 
94 aa  42.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 
270 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  44.29 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  36.36 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2275  hypothetical protein  38.37 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2489  PAS sensor protein  43.55 
 
 
366 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  37.66 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  40.91 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
95 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  43.06 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2280  hypothetical protein  39.73 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2596  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  37.97 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  44.16 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1666  PAS sensor protein  41.67 
 
 
341 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  hitchhiker  0.00438569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 
85 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>