36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0976 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  90.74 
 
 		 108 aa  197  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  97.83 
 
 		 92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  65.74 
 
 		 107 aa  127  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  47.92 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  43.62 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  45.59 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  41.46 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  36.05 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  39.73 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  35.29 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 267 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  34.09 
 
 		 276 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  39.02 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  39.06 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  40.58 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 1350 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  34.07 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  33.73 
 
 		 99 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>