48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3854 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  56.57 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2275  hypothetical protein  42 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  43.42 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  47.95 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  41.89 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  41.56 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  37.78 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24850  hypothetical protein  38.61 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  41.33 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  38.67 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 108 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  42.03 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  38.46 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  40.28 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  41.03 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  34.29 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  43.42 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  40.28 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1818  hypothetical protein  38.1 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  36.36 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  36.99 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  33.73 
 
 		 108 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  31.4 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  37.08 
 
 		 85 aa  40.8  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  36.36 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  32.88 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 103 aa  40  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  33.78 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>