48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1303 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  96.91 
 
 		 97 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  47.14 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  35.29 
 
 		 276 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 267 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  34.38 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  44 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  39.24 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  36.99 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  39.24 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  36.59 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  39.47 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  37.97 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  31.25 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  33.67 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  37.18 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  37.18 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  34.25 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 103 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 107 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  34.57 
 
 		 82 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  32.94 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 91 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>