52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4299 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  190  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 		 267 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  41.77 
 
 		 276 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  44.59 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  41.77 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  35.44 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  40.45 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  33.78 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  34.31 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  34.31 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  38.2 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2628  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  42.03 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 1350 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  35.96 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  36.99 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  38.67 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  34.33 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  32.26 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  35.48 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  44.29 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1860  PAS sensor protein  36.49 
 
 		 340 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1581  PAS sensor protein  36.49 
 
 		 340 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  36.36 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1666  PAS sensor protein  38.96 
 
 		 341 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  hitchhiker  0.00438569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  36.84 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5399  PAS sensor protein  37.33 
 
 		 338 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  30.12 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  31.76 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  38.24 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 105 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>