48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0528 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 87 aa  173  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  78.57 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  80.77 
 
 		 84 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  80.26 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  78.67 
 
 		 83 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  77.92 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  77.92 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  73.49 
 
 		 83 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  66.67 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  68.92 
 
 		 83 aa  97.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  68 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7427  hypothetical protein  58.21 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  44.74 
 
 		 361 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 77 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  37.84 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  39.19 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  38.64 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 267 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  38.16 
 
 		 276 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  35.53 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  38.81 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  38.36 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  40.28 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  40.48 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5399  PAS sensor protein  40.98 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  36.49 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4302  hypothetical protein  39.66 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 85 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  39.06 
 
 		 87 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  36.49 
 
 		 85 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 86 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  39.44 
 
 		 82 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4859  PAS domain-containing protein  39.34 
 
 		 338 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  35.48 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5345  PAS fold-3 domain protein  39.34 
 
 		 338 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>