47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1805 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  76.71 
 
 		 82 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5078  hypothetical protein  67.11 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  42.68 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  44.3 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  46.97 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  42.11 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  50.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  41.89 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  42.47 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  45.31 
 
 		 361 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 359 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  43.55 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  36.62 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  37.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 490 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  40.35 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  43.08 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2596  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  41.79 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  35.06 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 89 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  37.18 
 
 		 85 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  37.14 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  39.68 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 267 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  36.92 
 
 		 276 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  33.78 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>