17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2346 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  100 
 
 		 862 aa  1771    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  54.37 
 
 		 1271 aa  954    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  57.44 
 
 		 1180 aa  1038    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1133 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 1352 aa  327  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1260 aa  286  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 1242 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 1269 aa  277  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  26.42 
 
 		 1346 aa  277  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1253 aa  269  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 1350 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  26.71 
 
 		 1365 aa  266  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1251 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.56 
 
 		 1370 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  26.03 
 
 		 753 aa  212  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  25.51 
 
 		 532 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  30.15 
 
 		 720 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>