22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2280 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2280  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  47.89 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  39.13 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  41.89 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 217 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5399  putative PAS/PAC sensor protein  36.92 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686333  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  39.73 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  36 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 78 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 78 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 490 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 1350 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  39.73 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  36.62 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  44.26 
 
 		 100 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>