39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6546 on replicon NC_010507
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 79 aa  157  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  46.67 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  41.56 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  44.16 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  49.28 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  37.33 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  40.54 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 359 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2280  hypothetical protein  33.8 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  42.47 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  39.02 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  40.54 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  41.43 
 
 		 276 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2596  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  39.73 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  43.48 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 267 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 1350 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  39.19 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  35.44 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  36.84 
 
 		 93 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 82 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1719  hypothetical protein  46 
 
 		 226 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885175  normal  0.188868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  34.21 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5399  putative PAS/PAC sensor protein  37.88 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  43.66 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>