12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3689 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3689  hypothetical protein  100 
 
 
1702 aa  3466    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.558287 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4648  hypothetical protein  40.06 
 
 
1711 aa  1142    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4795  hypothetical protein  27.03 
 
 
1809 aa  261  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0123  hypothetical protein  25.56 
 
 
1793 aa  225  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5269  hypothetical protein  26.91 
 
 
1796 aa  191  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00229781  unclonable  0.0000748398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0639  hypothetical protein  24.74 
 
 
1622 aa  182  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0933  hypothetical protein  23.92 
 
 
1765 aa  80.1  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.686866  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3041  AAA ATPase  21.09 
 
 
1706 aa  71.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  22.96 
 
 
1180 aa  61.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2242  AAA ATPase  23.21 
 
 
1668 aa  61.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2308  hypothetical protein  20.17 
 
 
1535 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000339602 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0835  hypothetical protein  21.96 
 
 
1573 aa  45.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>