13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4795 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0639  hypothetical protein  38.62 
 
 
1622 aa  1040    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4795  hypothetical protein  100 
 
 
1809 aa  3645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5269  hypothetical protein  35.94 
 
 
1796 aa  920    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00229781  unclonable  0.0000748398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0123  hypothetical protein  37.07 
 
 
1793 aa  1122    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3689  hypothetical protein  27.12 
 
 
1702 aa  261  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.558287 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4648  hypothetical protein  26.24 
 
 
1711 aa  213  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0933  hypothetical protein  25.57 
 
 
1765 aa  104  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.686866  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2242  AAA ATPase  25.31 
 
 
1668 aa  73.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2308  hypothetical protein  21.92 
 
 
1535 aa  65.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000339602 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  25 
 
 
1180 aa  51.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0835  hypothetical protein  22.06 
 
 
1573 aa  50.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3942  hypothetical protein  25.49 
 
 
1649 aa  50.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0101  hypothetical protein  20.43 
 
 
1526 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>