126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2425 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2425  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  100 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  71.72 
 
 		 99 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674074  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  54.88 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  53.66 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.86 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.56 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.77 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.86 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.38 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  39.02 
 
 		 1365 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  42.03 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  41.77 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.77 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  36.25 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.33 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.74 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  37.93 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.88 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.65 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.07 
 
 		 1370 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  32.1 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.02 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.1 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.44 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2693  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.16 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.18 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.18 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.18 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.18 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1487  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.25 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.24 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  34.67 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4314  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.89 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.43 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.52 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.57 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  34.12 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.94 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.75 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.23 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.66 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1535  plasmid maintenance system antidote protein  35.44 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0393222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.52 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  37.18 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.44 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.8 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0929  putative antidote protein  40 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.52 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2106  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.05 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  35.29 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  32.43 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.43 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  32.43 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.43 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.62 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.17 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  32.43 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  24.42 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  32.22 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.63 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.06 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  31.08 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  32.94 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  31.08 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.93 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.27 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.33 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  31.87 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  29.87 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.18 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.06 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.75 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.86 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  30.38 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4131  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.18 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0937778  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.68 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2554  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.38 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276945  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  33.77 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.08 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  29.63 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.63 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.89 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.77 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  30.34 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  30.34 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.48 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.73 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>