147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_4040 on replicon NC_008320
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 98 aa  203  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  76.04 
 
 		 99 aa  156  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.25 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.24 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.33 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.11 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.89 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  40.24 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.17 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  40.24 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  40.24 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.24 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  40.24 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  40.24 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.24 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.24 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  40.24 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.21 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.72 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  37.8 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.17 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  42.31 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.59 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.8 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.52 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.68 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.68 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.47 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.06 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.68 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2524  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.83 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0379048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  35.06 
 
 		 1365 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  37.78 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.64 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  40.51 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.51 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.51 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.51 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.88 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.04 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4314  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.63 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.82 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  33.75 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.72 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  37.65 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.18 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  34.07 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0929  putative antidote protein  34.15 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.57 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.37 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.65 
 
 		 1370 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.04 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.56 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0834  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.53 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0431  hypothetical protein  32.53 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.03 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.37 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0276  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.03 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545625  normal  0.0676813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2649  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.03 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.634453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  42.37 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  30.26 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  38.03 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.96 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  33.33 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.44 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674074  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.33 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.622069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2425  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  35.44 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.77 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  28.09 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  32.47 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1065  plasmid maintenance system antidote protein  32.5 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  30.23 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.23 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.09 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.12 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.44 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3311  plasmid maintenance system antidote protein  33.78 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.68 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.03 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.97 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.49 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.72 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 386 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.89 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.97 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>