173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0929 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0929  putative antidote protein  100 
 
 		 105 aa  217  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0431  hypothetical protein  51.65 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0276  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.98 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545625  normal  0.0676813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2649  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.98 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.634453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.96 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.88 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0834  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.94 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1065  plasmid maintenance system antidote protein  53.85 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  46.15 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  46.15 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  46.15 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  55.56 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46.15 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  46.15 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.15 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  46.15 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0634  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.3 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.757193  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.46 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  43.33 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.22 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.21 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4314  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.37 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.61 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  42.65 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.2 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2693  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  40.24 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0214  virulence-associated protein, putative  51.25 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.756652  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.1 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  39.08 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.38 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.98 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.12 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.71 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.89 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.25 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0885  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.67 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673579  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2106  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.65 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.75 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.58 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.71 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  37.89 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.7 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.83 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  39.51 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  39.51 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.65 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.95 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  42.25 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.16 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  33.33 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.15 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.63 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  37.33 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4087  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.11 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.71 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.73 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2019  plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.93 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  32.32 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  32.89 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  39.71 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3935  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.33 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.25 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.11 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  36.11 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.47 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.05 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.47 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  34.18 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2763  virulence-associated protein, putative  35 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.76 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.63 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4131  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.29 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0937778  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.89 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1610  DNA-binding protein  26.44 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1906  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.71 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.21 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  34.18 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.72 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0672  plasmid maintenance system antidote protein  35.62 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15068  normal  0.669698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.88 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.94 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.44 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5479  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  31.03 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4370  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372671  normal  0.0360192 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>