146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2425 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 
99 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674074  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2425  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  71.72 
 
 
99 aa  147  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.78 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.32 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.23 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.77 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  45.21 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 
101 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  31.51 
 
 
1365 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.26 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  39.24 
 
 
96 aa  60.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.35 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.22 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.73 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.59 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.12 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.47 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.59 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.47 
 
 
1370 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.11 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  31.76 
 
 
105 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  37.23 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.74 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.38 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.71 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.93 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  35.63 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.46 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.25 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.44 
 
 
72 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  34.12 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1535  plasmid maintenance system antidote protein  38.03 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0393222  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.43 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.43 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.48 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  38.1 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.17 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.96 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  29.41 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  33.71 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1487  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.41 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.12 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.57 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  32.95 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.33 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390775  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.44 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.27 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  31.58 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  32.97 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.06 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.11 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.68 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.68 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.77 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  35.14 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  30 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  32.61 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2693  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  35.53 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.67 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  30.67 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.52 
 
 
99 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.15 
 
 
109 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.55 
 
 
96 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0929  putative antidote protein  35.53 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.8 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.76 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.95 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.63 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.37 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.5 
 
 
363 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.77 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.89 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.26 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2554  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.08 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276945  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  30.26 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>