179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42030 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  100 
 
 
95 aa  191  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  81.72 
 
 
93 aa  155  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  74.73 
 
 
97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  69.23 
 
 
95 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  60.67 
 
 
95 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  58.24 
 
 
101 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.17 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.17 
 
 
100 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.17 
 
 
100 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  55.81 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  49.43 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.36 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  52.44 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.31 
 
 
96 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.45 
 
 
91 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  45.16 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.15 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.84 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.33 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.94 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.94 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.44 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  43.04 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.56 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.19 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.98 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  41.98 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.78 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.51 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2524  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.33 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0379048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.14 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  51.61 
 
 
78 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.67 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.33 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  48.1 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.1 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  56.9 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.05 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.55 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  36.84 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.79 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  38.75 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.78 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.87 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.622069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 
107 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.96 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  41.46 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  39.74 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.74 
 
 
100 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1487  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.09 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.71 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  42.27 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  39.76 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.57 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.65 
 
 
98 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.9 
 
 
109 aa  58.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  41.1 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.04 
 
 
107 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  35.96 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.47 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.05 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.56 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  37.11 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35 
 
 
120 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  35 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  35 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  35 
 
 
120 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  35 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  35 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.24 
 
 
371 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  35 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  35 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.75 
 
 
109 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  38.57 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  39.29 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.64 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  39.29 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2425  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  37.93 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  32.61 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.63 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674074  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  32.61 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.61 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  32.61 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  32.61 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.61 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  32.61 
 
 
131 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  32.61 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  37.35 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35 
 
 
1370 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1407  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.56 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117941  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.66 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.79 
 
 
385 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.33 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  36.62 
 
 
1365 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>