123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2319 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 72 aa  143  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  73.44 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  82.76 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  70.97 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  64.52 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  67.24 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  57.97 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  61.02 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  53.62 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  57.63 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  57.63 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  57.63 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  53.85 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  57.63 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.45 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  58.93 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.38 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.27 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  52.54 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  56.6 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  55.93 
 
 		 93 aa  67  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  55.93 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  55.17 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.18 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.72 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.82 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  54.24 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  54.24 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  46.77 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.77 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  56.9 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.06 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.15 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.15 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.21 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.67 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.12 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.9 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0827  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.26 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  52.73 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  39.34 
 
 		 1365 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  50 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  50.98 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.44 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674074  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  63.16 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2425  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  49.02 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.92 
 
 		 1370 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  45.61 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.9 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  45.61 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  45.61 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.61 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  45.61 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  45.61 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  40.91 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.91 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  43.33 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  40.91 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.33 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  46 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3935  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.62 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.19 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  36.36 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.15 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.622069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.29 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  38.98 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.98 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  38.98 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1125  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.23 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.23 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  37.29 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  37.29 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  42 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2554  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276945  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.38 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.68 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  42.37 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.98 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  41.51 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.4 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4131  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.29 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0937778  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.62 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  48.08 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.9 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.59 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3561  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.37 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>