177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1677 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 93 aa  187  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  81.72 
 
 		 95 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  70 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  67.74 
 
 		 95 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  58.43 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  56.52 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  56.52 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  56.52 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  61.9 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  54.35 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.55 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  50 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  48.39 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.38 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  43.02 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.33 
 
 		 93 aa  84.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.89 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.38 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.05 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.31 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.31 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.5 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.31 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  43.02 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.57 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.53 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2524  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.05 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0379048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.45 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  58.93 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.72 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  48.72 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.89 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.74 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.47 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.87 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  39.51 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  53.33 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.51 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.26 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 		 100 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.26 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.21 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.36 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  42.25 
 
 		 1365 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.89 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  40.24 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  39.73 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.21 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.622069 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.97 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.11 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.73 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.25 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.75 
 
 		 1370 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.12 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674074  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1487  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.27 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.55 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.42 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.56 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.78 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  34.78 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  34.78 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  34.78 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  34.78 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  34.78 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  34.78 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 99 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  37 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  37.35 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  41.57 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  34.78 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.14 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  35.96 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.63 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.72 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.58 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  35.96 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.09 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.76 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  39.76 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  29.55 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  42.25 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 369 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.65 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  34.48 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.42 
 
 		 362 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.29 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1407  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.46 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>