179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0422 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  100 
 
 
97 aa  197  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  74.73 
 
 
95 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  70 
 
 
93 aa  135  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  69.32 
 
 
95 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.93 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  54.02 
 
 
101 aa  100  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.55 
 
 
100 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.55 
 
 
100 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.55 
 
 
100 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  51.72 
 
 
96 aa  94  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  51.16 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.35 
 
 
100 aa  90.5  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.09 
 
 
96 aa  86.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  49.43 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.14 
 
 
91 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.75 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.73 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  43.96 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.94 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.48 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.98 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.98 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.83 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.37 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.59 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.74 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.42 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  43.04 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  42.31 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.22 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.25 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.58 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.35 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.35 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  55.17 
 
 
72 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.26 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.71 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2524  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.78 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0379048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  39.02 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.57 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.65 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  41.03 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  35.29 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  36.9 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.71 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  36.14 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  47.46 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.26 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.75 
 
 
98 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.06 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 
101 aa  57.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.75 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.59 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  36.59 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.08 
 
 
1370 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  36.59 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  36.59 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.59 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  36.59 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  36.59 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  36.59 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.02 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  35.71 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1487  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.55 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645872  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  43.42 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  36.25 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.73 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  40.85 
 
 
1365 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.52 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.16 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  32.47 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  32.47 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.47 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.74 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  32.47 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.47 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  32.47 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1407  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.79 
 
 
103 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  32.47 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  32.47 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  35.62 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  36.25 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  38.16 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.34 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.14 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.78 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.622069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.67 
 
 
106 aa  52  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.59 
 
 
113 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.18 
 
 
101 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.77 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.82 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>