201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2894 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  100 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1906  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.84 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.66 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.48 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.31 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.33 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.32 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.57 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.24 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.35 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  42.67 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  38.46 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  38.46 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.42 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.42 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.33 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  46.75 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  48.75 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.71 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.42 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  41.94 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  48 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  41.94 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.04 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  48.61 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.61 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  41.56 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.15 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.61 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.33 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.59 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.75 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.67 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4131  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.1 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0937778  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.03 
 
 
369 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2942  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.71 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00934275  hitchhiker  0.000711707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2763  virulence-associated protein, putative  43.37 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.33 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  42.67 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.71 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2106  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.67 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4370  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.95 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372671  normal  0.0360192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.17 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.67 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  38.24 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.29 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.47 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.24 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.06 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 
373 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  34.18 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  39.24 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.24 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  39.47 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  38.24 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  38.89 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  38.24 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  38.24 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  38.24 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.74 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.67 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1610  DNA-binding protein  39.19 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.71 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.06 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.48 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.23 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.49 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.77 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.24 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  38.24 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.29 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.27 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.51 
 
 
368 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.57 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.85 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.84 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.68 
 
 
95 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.84 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2554  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276945  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0672  plasmid maintenance system antidote protein  45.83 
 
 
171 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15068  normal  0.669698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  37.11 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  40 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.35 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3561  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4764  plasmid maintenance system antidote protein  39.74 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.559463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>