122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1542 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 373 aa  771    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.19 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  45.78 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.72 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  42.32 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  39.79 
 
 		 386 aa  278  9e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.23 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.9 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.97 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.04 
 
 		 362 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  35.68 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.71 
 
 		 350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  32.6 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.67 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  32.6 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.76 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.57 
 
 		 228 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.37 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.66 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.09 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  61.97 
 
 		 116 aa  96.7  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  25.3 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.43 
 
 		 383 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.05 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.35 
 
 		 124 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  30.6 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  26.5 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  25.56 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2261  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.28 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000446898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  25.42 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  37.14 
 
 		 151 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  45.95 
 
 		 96 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.84 
 
 		 117 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.71 
 
 		 100 aa  60.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  42.86 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1368  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.29 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1480  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.65 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  36.96 
 
 		 107 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1407  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.44 
 
 		 103 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.53 
 
 		 108 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.8 
 
 		 101 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.15 
 
 		 118 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 102 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.24 
 
 		 98 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 98 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.08 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.05 
 
 		 101 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  32.11 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.43 
 
 		 100 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.19 
 
 		 100 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.47 
 
 		 101 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  43.48 
 
 		 104 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 104 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 104 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 		 101 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 102 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 		 106 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  25.85 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.25 
 
 		 103 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.02 
 
 		 104 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.4 
 
 		 106 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  31.78 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0431  hypothetical protein  37.08 
 
 		 108 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  33.72 
 
 		 103 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  33.72 
 
 		 101 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.9 
 
 		 95 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.09 
 
 		 99 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.8 
 
 		 100 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.9 
 
 		 105 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.54 
 
 		 99 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.54 
 
 		 99 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  37.68 
 
 		 99 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  33.33 
 
 		 99 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 98 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1065  plasmid maintenance system antidote protein  39.47 
 
 		 101 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.92 
 
 		 97 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 		 99 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0276  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 		 102 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545625  normal  0.0676813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2649  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 		 102 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.634453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.38 
 
 		 116 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.33 
 
 		 97 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3935  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 123 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  33.77 
 
 		 95 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.46 
 
 		 101 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  33.71 
 
 		 95 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.05 
 
 		 106 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1906  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 100 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1610  DNA-binding protein  32.94 
 
 		 100 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0834  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 102 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.46 
 
 		 101 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  32.58 
 
 		 101 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.46 
 
 		 101 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1535  plasmid maintenance system antidote protein  34.44 
 
 		 123 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0393222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.27 
 
 		 99 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  32.58 
 
 		 101 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>