47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0317 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  84.44 
 
 		 360 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  37.57 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.92 
 
 		 385 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.61 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  32.53 
 
 		 386 aa  199  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.6 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  30.42 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  28.33 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.61 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.81 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.09 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.51 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.93 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.44 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  27.03 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.4 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.26 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.51 
 
 		 228 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.09 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  23.86 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  24.45 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  23.41 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  24.63 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  31.72 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  23.03 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  26.6 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.4 
 
 		 124 aa  49.7  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.89 
 
 		 101 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  21.9 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.89 
 
 		 101 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.82 
 
 		 100 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.11 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  32.32 
 
 		 359 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  30.3 
 
 		 94 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  30.3 
 
 		 94 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  30.3 
 
 		 94 aa  43.1  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  30.3 
 
 		 94 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.3 
 
 		 94 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  30.3 
 
 		 94 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  30.3 
 
 		 94 aa  43.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  30.3 
 
 		 120 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.85 
 
 		 98 aa  42.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.3 
 
 		 120 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.16 
 
 		 106 aa  42.7  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>