102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0483 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 350 aa  728    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.71 
 
 		 373 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.16 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  31.18 
 
 		 380 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  31.2 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.13 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  31.84 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.19 
 
 		 228 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.76 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.59 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  33.62 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.33 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.23 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  27.51 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.36 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.07 
 
 		 362 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.29 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.61 
 
 		 376 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  23.16 
 
 		 367 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.14 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  28.14 
 
 		 425 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.15 
 
 		 361 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  27.03 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.87 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  22.06 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  25.15 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.31 
 
 		 116 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  37.5 
 
 		 94 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  37.5 
 
 		 94 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  37.5 
 
 		 94 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 94 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  37.5 
 
 		 94 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  37.5 
 
 		 94 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  25.32 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.71 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  39.39 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.44 
 
 		 101 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 		 124 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  41.79 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  45.45 
 
 		 78 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  25.57 
 
 		 408 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.62 
 
 		 106 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 		 93 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.24 
 
 		 101 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.47 
 
 		 95 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  29.05 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 101 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36 
 
 		 100 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0956  hypothetical protein  28.15 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215929  normal  0.12652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.84 
 
 		 95 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.9 
 
 		 151 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  30.69 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4764  plasmid maintenance system antidote protein  28.24 
 
 		 115 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.559463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 104 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.76 
 
 		 101 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.34 
 
 		 103 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  35.82 
 
 		 1365 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.88 
 
 		 101 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf310  hypothetical protein  23.1 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0154663  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  27.4 
 
 		 95 aa  46.6  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.55 
 
 		 95 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.88 
 
 		 101 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  30.11 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 110 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.97 
 
 		 101 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.07 
 
 		 98 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 91 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 91 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  30.26 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.41 
 
 		 100 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2261  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.82 
 
 		 76 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000446898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.85 
 
 		 98 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.43 
 
 		 99 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.49 
 
 		 105 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  32.84 
 
 		 95 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.04 
 
 		 104 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.59 
 
 		 93 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1368  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.72 
 
 		 102 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.76 
 
 		 95 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.08 
 
 		 108 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  30.14 
 
 		 101 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.34 
 
 		 99 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.88 
 
 		 96 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  30.14 
 
 		 103 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  31.67 
 
 		 105 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.36 
 
 		 96 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.85 
 
 		 107 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 102 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.15 
 
 		 99 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674074  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.08 
 
 		 109 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.85 
 
 		 100 aa  43.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.82 
 
 		 91 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5883  protein of unknown function DUF955  23.08 
 
 		 397 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>