131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1951 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 368 aa  768    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  68.22 
 
 		 369 aa  525  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.1 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.65 
 
 		 363 aa  308  8e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 		 373 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.36 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  41.57 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  38.38 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.42 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  36.8 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.89 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.81 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  76.67 
 
 		 116 aa  155  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.33 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  26.93 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.07 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  60.42 
 
 		 124 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  29.02 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.18 
 
 		 228 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.74 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.8 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.12 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  25.48 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  24.93 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.62 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  26.37 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  23.15 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  27.23 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.25 
 
 		 101 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2261  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.62 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000446898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.84 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.66 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  20.98 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  30.36 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 98 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  26.36 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.9 
 
 		 108 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  39.51 
 
 		 119 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.05 
 
 		 99 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.8 
 
 		 106 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.85 
 
 		 100 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.89 
 
 		 101 aa  57  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.25 
 
 		 106 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.72 
 
 		 105 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 		 151 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  36.25 
 
 		 151 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  41.67 
 
 		 96 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  40.58 
 
 		 107 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.65 
 
 		 103 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0431  hypothetical protein  34.12 
 
 		 108 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.75 
 
 		 95 aa  52.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0276  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.47 
 
 		 102 aa  52.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545625  normal  0.0676813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2649  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.47 
 
 		 102 aa  52.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.634453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1407  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.75 
 
 		 103 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117941  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  36.84 
 
 		 104 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.06 
 
 		 118 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0834  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.18 
 
 		 102 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1480  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 		 102 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1368  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.28 
 
 		 102 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 		 116 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 98 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1065  plasmid maintenance system antidote protein  41.18 
 
 		 101 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.14 
 
 		 101 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.89 
 
 		 102 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  35.71 
 
 		 95 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  33.72 
 
 		 102 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 101 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 		 100 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.79 
 
 		 100 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.89 
 
 		 128 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 104 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.72 
 
 		 98 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.25 
 
 		 96 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  30.26 
 
 		 95 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 		 101 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  31.94 
 
 		 103 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  31.94 
 
 		 101 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.53 
 
 		 100 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.38 
 
 		 95 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.62 
 
 		 93 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  34.72 
 
 		 99 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.67 
 
 		 103 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1535  plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 123 aa  46.6  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0393222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.35 
 
 		 93 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.94 
 
 		 120 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2763  virulence-associated protein, putative  33.77 
 
 		 100 aa  46.2  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  31.94 
 
 		 120 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 107 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.77 
 
 		 110 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.29 
 
 		 104 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35 
 
 		 104 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.51 
 
 		 106 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  31.94 
 
 		 94 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30 
 
 		 132 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0634  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.29 
 
 		 102 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.757193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.94 
 
 		 94 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  31.94 
 
 		 94 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  31.94 
 
 		 94 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.25 
 
 		 97 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>