102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0275 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  100 
 
 		 386 aa  786    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.59 
 
 		 385 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.79 
 
 		 373 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.59 
 
 		 371 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  39.57 
 
 		 380 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.38 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.85 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.57 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.88 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  35.34 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.71 
 
 		 363 aa  206  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.98 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  32.53 
 
 		 360 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  35.28 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.84 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  30.03 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.08 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.04 
 
 		 292 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.19 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.13 
 
 		 228 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.91 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  35.25 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.35 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  30.22 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  24.07 
 
 		 401 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  27.97 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.05 
 
 		 116 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.68 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.31 
 
 		 106 aa  60.5  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.66 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.75 
 
 		 101 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.72 
 
 		 99 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 101 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.8 
 
 		 117 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.14 
 
 		 98 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  27.74 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  41.79 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.51 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  39.19 
 
 		 102 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 104 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.56 
 
 		 100 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  28.49 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  37.31 
 
 		 107 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 101 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  44.78 
 
 		 95 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  24.82 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.09 
 
 		 100 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  31.94 
 
 		 119 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 		 95 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 98 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  40.3 
 
 		 96 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.79 
 
 		 95 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.07 
 
 		 103 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 		 93 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.54 
 
 		 95 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 		 108 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.43 
 
 		 101 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.43 
 
 		 101 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.43 
 
 		 101 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1065  plasmid maintenance system antidote protein  40.32 
 
 		 101 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.42 
 
 		 106 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.66 
 
 		 98 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.93 
 
 		 116 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 96 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0834  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 		 102 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1535  plasmid maintenance system antidote protein  30.68 
 
 		 123 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0393222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.66 
 
 		 100 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 		 118 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  35.37 
 
 		 1365 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.85 
 
 		 101 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 		 151 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 95 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  23.18 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.78 
 
 		 106 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 107 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 93 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.49 
 
 		 102 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  38.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  38.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  38.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  38.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  38.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.79 
 
 		 102 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.33 
 
 		 120 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.95 
 
 		 99 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  38.33 
 
 		 120 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.29 
 
 		 110 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  33.8 
 
 		 151 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  35 
 
 		 167 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.85 
 
 		 109 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.85 
 
 		 103 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  32.84 
 
 		 104 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 99 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  35.82 
 
 		 99 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  29.76 
 
 		 99 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  35.71 
 
 		 103 aa  43.1  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.34 
 
 		 101 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  37.68 
 
 		 78 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>