127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0415 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  100 
 
 		 78 aa  164  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  97.44 
 
 		 98 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  55.56 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.62 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.62 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  56.25 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.62 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  47.3 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.58 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.31 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.22 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.7 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.23 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  51.61 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.3 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.95 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.57 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.33 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.19 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.66 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.27 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.12 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.54 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.54 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.77 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  39.47 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2425  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  42.03 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  49.23 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.54 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  47.46 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.18 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.22 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.22 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  47.27 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.15 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.22 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.97 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  42.86 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  47.54 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.33 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  60 
 
 		 1370 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.45 
 
 		 350 aa  53.9  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2524  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0379048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  63.16 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.61 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  43.28 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  53.57 
 
 		 1365 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.28 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674074  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.85 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  37.14 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.37 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  30.26 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  35.9 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.9 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.83 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.622069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.66 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0929  putative antidote protein  37.31 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.51 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.38 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  39.66 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  39.66 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  39.66 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.66 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  39.66 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  39.66 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  39.66 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.51 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  36.51 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2554  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.33 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276945  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  30.43 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2693  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  36.23 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.88 
 
 		 363 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3561  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.33 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1487  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.73 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645872  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.66 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.66 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  38.71 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  41.07 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  41.07 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 		 368 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  34.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.93 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  40.35 
 
 		 380 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  34.38 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.93 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  32.79 
 
 		 371 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>