45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0743 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  49.07 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  46.13 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  32.91 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  33.04 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  29.89 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  35.21 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  32.48 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  26.82 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  34.75 
 
 		 168 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  27.46 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  27.44 
 
 		 171 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  32.14 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  32 
 
 		 173 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  31.33 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  28.79 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  28.1 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  29.45 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  29.53 
 
 		 182 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  27.97 
 
 		 302 aa  48.9  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  27.78 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  27.78 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  27.78 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  39.36 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  25.46 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  29.81 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  32.06 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  36.49 
 
 		 224 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  36.49 
 
 		 224 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  28.46 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  25.51 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  28.97 
 
 		 435 aa  45.8  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  28.97 
 
 		 435 aa  45.8  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  24.26 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  31.03 
 
 		 147 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  31.4 
 
 		 425 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  24.11 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  27.52 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  24.11 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  35.25 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  37.66 
 
 		 366 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  33 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1009  hypothetical protein  39.66 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  25.33 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>