41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1156 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  621  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  51.85 
 
 
295 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  47.86 
 
 
296 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  27.4 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  34.03 
 
 
270 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  40.57 
 
 
173 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  29.17 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  26.24 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  26.24 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  26.24 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  26.34 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  28.39 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  26.13 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  33.94 
 
 
174 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  32.71 
 
 
254 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  35.96 
 
 
170 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  29.27 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  28.31 
 
 
171 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  30.28 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2929  protein of unknown function DUF955  31.22 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  27.41 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  38.14 
 
 
182 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  27.92 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  29.77 
 
 
271 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  35.09 
 
 
168 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  29.92 
 
 
147 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  29.77 
 
 
271 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  25.84 
 
 
269 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  31.18 
 
 
435 aa  46.2  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  31.18 
 
 
435 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  32.45 
 
 
175 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  23.7 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  31.58 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  28.76 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  34.95 
 
 
160 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  33.96 
 
 
177 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  33.82 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  26.32 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  23.87 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  27.66 
 
 
257 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>