41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2203 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  579  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  44.96 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  41.83 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  41.83 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  41.83 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  39.41 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  42.74 
 
 		 289 aa  175  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  39.11 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  39.19 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  36.99 
 
 		 292 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  30.22 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  32.5 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  29.37 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  29 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  28.07 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  35.14 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  30.12 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  25.35 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  31.78 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  28.39 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  31.78 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  34.68 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  28.93 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  27.35 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  25.95 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  26.2 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  36.63 
 
 		 350 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  27.48 
 
 		 359 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 355 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  28.1 
 
 		 182 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1566  hypothetical protein  53.66 
 
 		 130 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902821  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  31.91 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  30.08 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  30.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  38.36 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  34.52 
 
 		 188 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  29.41 
 
 		 362 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  26.67 
 
 		 399 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  30 
 
 		 357 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>