45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0551 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  58.16 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  26.72 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  27.27 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  33.52 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  36.42 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  30.48 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  26.15 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  26.15 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  26.15 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  31.84 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  23.94 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  30.59 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  29.84 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  29.84 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  26.67 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  28.92 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  32.8 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  24 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  35.54 
 
 		 174 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  26.38 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  37 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  31.15 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  38.46 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  31.25 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  28 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  29.6 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  23.78 
 
 		 160 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  35.04 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  29.45 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  30.09 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  30.81 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  25.78 
 
 		 177 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  29.01 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  26.92 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  36.14 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  36.14 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  26.19 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  30.3 
 
 		 142 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  32.52 
 
 		 165 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>