37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0868 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0781  hypothetical protein  32.89 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  38.61 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  32 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  38.67 
 
 
175 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  29.46 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  36.14 
 
 
181 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  22.29 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  36.49 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  39.39 
 
 
362 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  29.81 
 
 
355 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  32.17 
 
 
246 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  38.1 
 
 
147 aa  45.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  27.4 
 
 
285 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  32.73 
 
 
261 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  34.91 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  38.81 
 
 
360 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  28.23 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  26.47 
 
 
352 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  32.31 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  38.81 
 
 
359 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  34.21 
 
 
390 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  30.7 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  37.5 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  27.62 
 
 
349 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  38.46 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  32.94 
 
 
295 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  30 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  30.11 
 
 
254 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  29.46 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 
269 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1262  hypothetical protein  26 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.228551  normal  0.373581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0956  hypothetical protein  28.1 
 
 
327 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215929  normal  0.12652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  30.36 
 
 
267 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  29 
 
 
347 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  29.25 
 
 
355 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>