40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1121 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  37.61 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  33.13 
 
 
177 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  31.54 
 
 
289 aa  52.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  35.63 
 
 
147 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  27.12 
 
 
385 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  31.34 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  29.59 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  29.81 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  28.71 
 
 
357 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  28.1 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.82 
 
 
182 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  30 
 
 
386 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  29.59 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  27.45 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  35.64 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  23.87 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  28.21 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  35.79 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  28.21 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  31.21 
 
 
173 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  24.78 
 
 
347 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  35 
 
 
156 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  29.17 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  37.74 
 
 
169 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  27.36 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  26.53 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  26.49 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  26.53 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  32.41 
 
 
160 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  28.38 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  32.74 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  26.83 
 
 
366 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  26.96 
 
 
381 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  28.71 
 
 
346 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 
367 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  34.25 
 
 
425 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  30.36 
 
 
224 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  30.36 
 
 
224 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>