21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2058 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4638  protein of unknown function DUF955  45.11 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  36.59 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  32.28 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  29.2 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  29.55 
 
 		 177 aa  48.5  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  32.74 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  31.5 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  31.88 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  31.21 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3252  hypothetical protein  33.64 
 
 		 376 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  33.06 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  35.29 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  30.71 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  30.71 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  28.95 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4678  protein of unknown function DUF955  30.25 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  26.58 
 
 		 170 aa  42.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  28.57 
 
 		 415 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>