18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4971 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4971  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 111 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2262  helix-turn-helix domain-containing protein  50.93 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441916  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  37.65 
 
 		 393 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  23.42 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  30.88 
 
 		 117 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 104 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  31 
 
 		 135 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  32 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.12 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 321 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>