28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3220 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3220  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 95 aa  177  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0990  transcriptional regulator, XRE family  63.41 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3439  transcriptional regulator, XRE family  67.11 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36440  Helix-turn-helix protein  64.1 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.809869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1431  XRE family transcriptional regulator  62.03 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0869  XRE family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1792  transcriptional regulator, XRE family  57.61 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2801  helix-turn-helix domain protein  58.23 
 
 		 99 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0262398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4445  putative transcriptional regulator, XRE family  62.16 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000092708  hitchhiker  0.000866745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0390  helix-turn-helix domain-containing protein  60.92 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2292  XRE family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00214116  hitchhiker  0.0019025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1534  transcriptional regulator, XRE family  70 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4952  putative transcriptional regulator, XRE family  58.11 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.368473  normal  0.877055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4156  XRE family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  decreased coverage  0.00010611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0783  helix-turn-helix domain-containing protein  56.16 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3774  helix-turn-helix domain-containing protein  56.76 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3081  helix-turn-helix domain-containing protein  55.26 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.180494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3124  helix-turn-helix domain-containing protein  55.26 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2928  transcriptional regulator, XRE family  60.81 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2966  helix-turn-helix domain protein  57.81 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4375  helix-turn-helix domain protein  56.58 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0190  transcriptional regulator, XRE family  47.73 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995138  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>