42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1534 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1534  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 85 aa  163  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3439  transcriptional regulator, XRE family  72.37 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2292  XRE family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 92 aa  105  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00214116  hitchhiker  0.0019025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4445  putative transcriptional regulator, XRE family  68.92 
 
 		 84 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000092708  hitchhiker  0.000866745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3220  helix-turn-helix domain protein  72.37 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36440  Helix-turn-helix protein  68.92 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.809869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1431  XRE family transcriptional regulator  64.94 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1792  transcriptional regulator, XRE family  66.22 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2801  helix-turn-helix domain protein  60.71 
 
 		 99 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0262398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3124  helix-turn-helix domain-containing protein  63.16 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3081  helix-turn-helix domain-containing protein  63.16 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.180494 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0869  XRE family transcriptional regulator  63.01 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0990  transcriptional regulator, XRE family  61.04 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0390  helix-turn-helix domain-containing protein  62.16 
 
 		 88 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4952  putative transcriptional regulator, XRE family  58.11 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.368473  normal  0.877055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2928  transcriptional regulator, XRE family  63.64 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407893  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3774  helix-turn-helix domain-containing protein  52.44 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2966  helix-turn-helix domain protein  60.94 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0783  helix-turn-helix domain-containing protein  54.67 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4156  XRE family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  decreased coverage  0.00010611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4375  helix-turn-helix domain protein  56.58 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2386  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 516 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 236 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 236 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 193 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0190  transcriptional regulator, XRE family  47.5 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995138  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 179 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 179 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 179 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 179 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 179 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 179 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>