24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0990 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0990  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 91 aa  174  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36440  Helix-turn-helix protein  61.25 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.809869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1431  XRE family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1792  transcriptional regulator, XRE family  57.61 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2801  helix-turn-helix domain protein  58.23 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0262398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3220  helix-turn-helix domain protein  66.67 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4445  putative transcriptional regulator, XRE family  65.28 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000092708  hitchhiker  0.000866745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0390  helix-turn-helix domain-containing protein  64.86 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0869  XRE family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2928  transcriptional regulator, XRE family  59.09 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3439  transcriptional regulator, XRE family  57.83 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2292  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 92 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00214116  hitchhiker  0.0019025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0783  helix-turn-helix domain-containing protein  55.13 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4952  putative transcriptional regulator, XRE family  55.13 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.368473  normal  0.877055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3081  helix-turn-helix domain-containing protein  56.76 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.180494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3124  helix-turn-helix domain-containing protein  56.76 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4156  XRE family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  decreased coverage  0.00010611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3774  helix-turn-helix domain-containing protein  54.05 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2966  helix-turn-helix domain protein  60.94 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1534  transcriptional regulator, XRE family  61.04 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4375  helix-turn-helix domain protein  51.65 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 220 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 218 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 201 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>