30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4445 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4445  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 84 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000092708  hitchhiker  0.000866745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2292  XRE family transcriptional regulator  78.08 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00214116  hitchhiker  0.0019025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3439  transcriptional regulator, XRE family  68.92 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0990  transcriptional regulator, XRE family  60.71 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1792  transcriptional regulator, XRE family  68.06 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0869  XRE family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1431  XRE family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36440  Helix-turn-helix protein  65.38 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.809869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3220  helix-turn-helix domain protein  62.16 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2801  helix-turn-helix domain protein  64.1 
 
 		 99 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0262398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1534  transcriptional regulator, XRE family  63.86 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2928  transcriptional regulator, XRE family  62.65 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3081  helix-turn-helix domain-containing protein  58.02 
 
 		 97 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.180494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3124  helix-turn-helix domain-containing protein  58.02 
 
 		 97 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0390  helix-turn-helix domain-containing protein  62.67 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4952  putative transcriptional regulator, XRE family  55.84 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.368473  normal  0.877055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2966  helix-turn-helix domain protein  62.5 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3774  helix-turn-helix domain-containing protein  55.26 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0783  helix-turn-helix domain-containing protein  50.65 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4156  XRE family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  decreased coverage  0.00010611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4375  helix-turn-helix domain protein  57.33 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 236 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 236 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 263 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>