47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0390 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0390  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 88 aa  166  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3081  helix-turn-helix domain-containing protein  70.67 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.180494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3124  helix-turn-helix domain-containing protein  70.67 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2928  transcriptional regulator, XRE family  63.64 
 
 		 88 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1431  XRE family transcriptional regulator  67.57 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4156  XRE family transcriptional regulator  64 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  decreased coverage  0.00010611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36440  Helix-turn-helix protein  64.86 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.809869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3774  helix-turn-helix domain-containing protein  58.14 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2801  helix-turn-helix domain protein  66.67 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0262398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0990  transcriptional regulator, XRE family  64.86 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1792  transcriptional regulator, XRE family  64.86 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2292  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00214116  hitchhiker  0.0019025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3220  helix-turn-helix domain protein  64.86 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0869  XRE family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4952  putative transcriptional regulator, XRE family  58.67 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.368473  normal  0.877055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2966  helix-turn-helix domain protein  67.19 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3439  transcriptional regulator, XRE family  59.46 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4445  putative transcriptional regulator, XRE family  62.16 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000092708  hitchhiker  0.000866745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0783  helix-turn-helix domain-containing protein  52.05 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1534  transcriptional regulator, XRE family  62.16 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4375  helix-turn-helix domain protein  61.33 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  41.56 
 
 		 202 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  41.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  41.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  41.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  41.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  41.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  41.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  41.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 198 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  40.58 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 203 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 208 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 203 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>