28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2928 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2928  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 88 aa  169  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3124  helix-turn-helix domain-containing protein  72 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3081  helix-turn-helix domain-containing protein  72 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.180494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0390  helix-turn-helix domain-containing protein  63.64 
 
 		 88 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3774  helix-turn-helix domain-containing protein  68.35 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4156  XRE family transcriptional regulator  67.09 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  decreased coverage  0.00010611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4952  putative transcriptional regulator, XRE family  65.38 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.368473  normal  0.877055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0783  helix-turn-helix domain-containing protein  69.44 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2966  helix-turn-helix domain protein  76.56 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0990  transcriptional regulator, XRE family  59.09 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2801  helix-turn-helix domain protein  61.54 
 
 		 99 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0262398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36440  Helix-turn-helix protein  60.26 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.809869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1431  XRE family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1792  transcriptional regulator, XRE family  60.53 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2292  XRE family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00214116  hitchhiker  0.0019025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4445  putative transcriptional regulator, XRE family  63.51 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000092708  hitchhiker  0.000866745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0869  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3439  transcriptional regulator, XRE family  59.46 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3220  helix-turn-helix domain protein  60.81 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1534  transcriptional regulator, XRE family  63.64 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4375  helix-turn-helix domain protein  58.67 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 170 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 356 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 207 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>