26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1431 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1431  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 100 aa  194  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1792  transcriptional regulator, XRE family  81 
 
 		 100 aa  156  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0869  XRE family transcriptional regulator  81.44 
 
 		 97 aa  147  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36440  Helix-turn-helix protein  92.31 
 
 		 92 aa  141  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.809869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2801  helix-turn-helix domain protein  88.89 
 
 		 99 aa  140  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0262398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0990  transcriptional regulator, XRE family  58.62 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0390  helix-turn-helix domain-containing protein  67.57 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2292  XRE family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 92 aa  95.9  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00214116  hitchhiker  0.0019025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3220  helix-turn-helix domain protein  65.33 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3439  transcriptional regulator, XRE family  58.23 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4445  putative transcriptional regulator, XRE family  66.67 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000092708  hitchhiker  0.000866745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3124  helix-turn-helix domain-containing protein  56.1 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3081  helix-turn-helix domain-containing protein  56.1 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.180494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2928  transcriptional regulator, XRE family  58.97 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4952  putative transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.368473  normal  0.877055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2966  helix-turn-helix domain protein  62.5 
 
 		 86 aa  76.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0783  helix-turn-helix domain-containing protein  51.28 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3774  helix-turn-helix domain-containing protein  52.7 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4156  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  decreased coverage  0.00010611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1534  transcriptional regulator, XRE family  64.94 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4375  helix-turn-helix domain protein  57.75 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2246  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>