31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2298 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  29.93 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2707  hypothetical protein  31.39 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1059  hypothetical protein  27.64 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  29.5 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  44.44 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1422  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  43.75 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  36.67 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3662  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  40.98 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  28.99 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  30.16 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  37.1 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3220  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  36.92 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  40.62 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  26.83 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  30 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2292  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00214116  hitchhiker  0.0019025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  34.38 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  40.32 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>