98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1454 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 116 aa  239  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2505  transcriptional regulator, XRE family  58.41 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.400727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2004  hypothetical protein  35.45 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 139 aa  48.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  38.24 
 
 		 421 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  38.24 
 
 		 421 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 304 aa  47  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 383 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 217 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  32.81 
 
 		 293 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  35.94 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  37.04 
 
 		 352 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  29.03 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3106  XRE family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 513 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  22.78 
 
 		 195 aa  42.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  30.11 
 
 		 359 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2958  transcriptional regulator HTH family  35.09 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2233  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0669523  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  48.89 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  47.5 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  28.77 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  28.77 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  28.77 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  28.77 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  28.77 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 489 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 147 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6209  hypothetical protein  37.29 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 300 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 178 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 247 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 81 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1563  repressor protein CI homolog  34.43 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  24.71 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  32.08 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 322 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1818  helix-turn-helix domain protein  30.19 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0350108  decreased coverage  0.0000000000623016 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  29.58 
 
 		 192 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  33.87 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0845  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000284644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 293 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1959  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.127837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 276 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 89 aa  40  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0219  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  25.64 
 
 		 324 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.855188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 281 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 		 81 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  30.14 
 
 		 95 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 68 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2266  helix-turn-helix domain protein  31.37 
 
 		 109 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0639842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>