70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1492 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  100 
 
 
125 aa  254  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  64 
 
 
126 aa  176  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  65.6 
 
 
126 aa  175  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  64.8 
 
 
126 aa  173  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  66.4 
 
 
126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  64.52 
 
 
125 aa  170  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  65.6 
 
 
126 aa  167  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  64 
 
 
126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  60.8 
 
 
126 aa  164  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  63.49 
 
 
126 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  62.71 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  62.4 
 
 
126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  64.96 
 
 
124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  62.39 
 
 
124 aa  159  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  60 
 
 
126 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  61.79 
 
 
124 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  63.71 
 
 
127 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  60.66 
 
 
126 aa  154  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  57.26 
 
 
131 aa  152  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  59.17 
 
 
125 aa  152  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  61.34 
 
 
126 aa  153  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  60.17 
 
 
125 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  55.28 
 
 
127 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  56.35 
 
 
131 aa  140  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  53.17 
 
 
127 aa  139  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  54.78 
 
 
126 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  56.56 
 
 
126 aa  135  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  47.2 
 
 
128 aa  120  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  47.46 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  46.67 
 
 
126 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  45 
 
 
126 aa  100  9e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  50 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  38.74 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  46.22 
 
 
124 aa  87.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  43.96 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.05 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  32.23 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  43.43 
 
 
181 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.27 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.28 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  35.4 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.04 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  65.71 
 
 
41 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.51 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  64.71 
 
 
41 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  61.11 
 
 
41 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  63.64 
 
 
42 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  61.76 
 
 
55 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  61.76 
 
 
55 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  35.79 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  61.76 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  44.68 
 
 
216 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  38.54 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  26.23 
 
 
198 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  50 
 
 
47 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  44.68 
 
 
215 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  34.31 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  30.19 
 
 
272 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  42.55 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  44.68 
 
 
215 aa  44.7  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  32.63 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  55.56 
 
 
39 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  25.81 
 
 
197 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1284  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  48.65 
 
 
55 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.1144  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  32.46 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  32.46 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  30.7 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  59.38 
 
 
38 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  30.09 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>